1、性质不同：杂交水稻是选用两个在遗传上有一定差异，同时它们的优良性状又能互补的水稻品种进行杂交，生产具有杂种优势的第一代杂交种；普通水稻属于谷类作物。 2、谷壳厚度不同：
1、性质不同：杂交水稻是选用两个在遗传上有一定差异，同时它们的优良性状又能互补的水稻品种进行杂交，生产具有杂种优势的第一代杂交种；普通水稻属于谷类作物。
2、谷壳厚度不同：谷壳轻薄的为杂交水稻种子，谷壳较厚的为普通水稻种子。
3、谷类颜色不同：杂交水稻的种子谷尖多呈紫色；普通水稻种子谷尖大多无色。
4、外稃痕迹不同：外稃和内稃交界处有一个小黑圆点的是杂交水稻，无黑点的是普通水稻。
5、种子形状不同：一般籼稻的杂交种细长，粳稻的种子较圆；杂交稻种子的腹部呈凹形，而非杂交稻种子腹部呈直线。
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